本作现实世界的时间在英灵殿之后，回忆中（主要操控）的时间在英灵殿之前。
玩家将扮演巴辛姆·伊本·伊沙克——无形者刺客组织的大师，在公元8世纪的巴格达区域展开活动。
巴辛姆这位黎凡特无形者，同时亦是伊述人洛基利用世界树保留自己意识并在大灾变后凭借人类之身觉醒的一位圣者。
不过，故事的开始他还只是巴格达街头的小蟊贼。
巴辛姆在巴格达的街头挣扎求生。
梦想着更好的未来，却时时被噩梦惊醒。
公元8、9世纪的伊斯兰世界达到了极盛。
巴格达则是阿拔斯王朝繁华的心脏。
但是，繁荣的表象下，上古维序者教会仍旧在侵蚀着这片土地。
你将成为巴辛姆，成为无形者，成为大师，成为他们的领袖。
最终担负起对抗教会，对抗黑暗的重责。
